2003年，日本一些機場曾安裝了紅外熱像儀裝置，用于應對SARS大爆發。隨著美洲各國相繼爆發豬流感，這些裝置被啟用，用來監測從墨西哥、美國等國歸來的民眾。這種紅外熱像儀通過紅外攝像頭測量人體溫度，能夠感應到旅客因感染豬流感而表現出的發熱狀態。

　　檢疫部門官員還要求從墨西哥返回的民眾向檢疫辦公室報告發熱、咳嗽以及其他感染豬流感的可能癥狀。各大機場官員也正與衛生部門緊密聯系，以決定是否對被機場檢疫站檢測出有豬流感癥狀的乘客進行隔離。

　　麻生太郎的首相辦公室下屬的危機處理中心已經設置了專門的聯絡處，用于收集有關豬流感爆發的信息。衛生部門還設立了10部電話專線，向焦慮的民眾解釋豬流感病毒爆發的情況。他們還勸解計劃前往墨西哥旅行的民眾，考慮取消行程。

　　目前日本政府還沒有收到任何疑似病例的報告。日本政府表示，如果世界衛生組織確認了豬流感病毒可以在人與人之間傳播，麻生太郎首相將組建特別行動小組，專門處理此次危機。總部設在墨西哥的日本公司正在收集是否有在墨日本人感染豬流感病毒的相關信息。豐田汽車集團正準備向美國和加拿大工廠的工人發放口罩，日產已經要求其在疫區的員工前往醫院檢查身體。

　　日本農業、林業以及漁業部門也警告稱，日本國內動物檢疫辦公室將對從疫區運往日本的活豬進行檢疫。但現在還沒有要求對進口豬肉產品進行檢疫，因為這種新型豬流感病毒經過高溫處理就會死亡，其粘附在豬肉上的可能性非常低。2008年，164頭從美國進口的活豬曾被檢測出帶有豬流感病毒。